Paraguay es un país mediterráneo cuyo sistema de transporte de carga doméstico se realiza por carreteras (monomodal), en tanto que el 75% de su comercio exterior es transportado por la Hidrovía Paraguay-Paraná.

En los últimos años, el dinamismo económico y la intensificación del movimiento comercial a través de la Hidrovía han posibilitado el surgimiento de nuevos puertos, casi todos privados, así como la modernización de los antiguos. En Paraguay los puertos más importantes son Asunción y Pilar. La Hidrovía Paraguay-Paraná se inicia en Puerto Cáceres en el estado de Mato Grosso, Brasil, termina en Puerto Nueva Palmira, Uruguay, y desemboca al mar por medio del Río de la Plata. Existen actualmente una decena de puertos privados situados sobre los ríos Paraná y Paraguay que se especializan en la logística de granos, mientras que solo Asunción y Pilar disponen de servicios de transporte y logística para contenedores. La mayoría de los puertos privados tienen una capacidad relativamente limitada.